输血后，有一定比例的受血者，会发生输血不良反应或感染传染病。不良反应是指在输血过程或输血后，受血者发生的原先疾病不能解释的、新的症状或体征。比如过敏、发热、溶血、心衰等。另外，污染了病原体的血液输入到人体内，则会引起相应的疾病。

　　近年来，对输血传染病已经加强了控制，但由于当前科技水平的限制，一些传染病的病毒感染“窗口期”，难以检出，极少数受血者会面临得传染病的风险。“窗口期”是指，被感染的献血者，在接触病毒(如艾滋病病毒、乙肝病毒等)后到能在血液中检测出该病毒抗体前的这段时间。但紧急情况时，因担心较小概率的输血不良反应而不输血，则会在当下，造成更大的危险。所以，在输血前，医生有责任详尽地告知患者输血和不输血的风险。